Купуючи версію коробочки і отримуючи все необхідне для установки продукту, не варто забувати про те, що придбання програмного забезпечення - це придбання ліцензії, тобто певних (обмежених) прав на використання конкретного продукту. Для коробкових версій ці права регулюються умовами Ліцензійної угоди з кінцевим користувачем.
Ліцензійна угода з кінцевим користувачем найчастіше поширюється в електронному вигляді і відображається при першому запуску продукту. В угоді обумовлюються такі важливі аспекти використання, як кількість установок по одній ліцензії, можливість перенесення продукту на інший ПК, необхідність активації і наявність технічної підтримки Microsoft, а також перераховуються необхідні компоненти для підтвердження легальності ПЗ. Право використання попередньої версії (Downgrade) не доступно для коробкових ліцензій, за винятком деяких засобів розробки і серверів.